Анализ транскриптомных данных

Курс «Анализ транскриптомных данных» посвящён анализу данных экспрессий генов, полученных при помощи платформ высокопроизводительного секвенирования.

В ходе курса будут освещены как вопросы анализа данных bulk RNA-Seq, так и становящихся всё более популярных в последние годы данных scRNA-Seq. Особое внимание будет уделено методам машинного обучения (от GLM до VAE и методов снижения размерности), которые сейчас являются «золотым стандартом» на всех стадиях работы с транскриптомными данными.

Курс состоит из 15 лекций и 15 семинаров. На лекциях основное внимание будет уделено теоретическим основам применяемых методов анализа, а также дискуссиям насчёт областей применимости тех или иных подходов. На семинарах будут рассмотрены конкретные примеры использования различных инструментов, а также рассмотрены некоторые углубленные вопросы из курса. После каждого семинара будет даваться домашнее задание, направленное на закрепление материалов, полученных на занятии.

Типичный слушатель курса — это студент естественно-научной специальности, который хочет овладеть современными методами анализа экспрессионных данных, а также качественно применять их в своей исследовательской работе. Для того, чтобы полностью освоить курс, требуется владение языками Python и R, а также базовое понимание статистики, теории вероятностей и линейной алгебры.

Страница курса: https://intellect-foundation.r...

Материалы к курсу: https://drive.google.com/drive...