Лекция 10. Коррекция батч-эффекта | Открытые видеолекции учебных курсов МГУ

Лекция 10. Коррекция батч-эффекта

Лекция из курса:

Анализ транскриптомных данных

Исаев Сергей Валентинович

Видео не может быть загружено из-за проблем с интернет-соединением или проблем на сервере. Или формат файла не поддерживается вашим браузером.

Лекция 10. Коррекция батч-эффекта

Видео закончится через

NaN:NaN

00:00

00:00

00:19

Следующая секция начнется через 13:50

Стандартный процессинг датасета

13:50

Следующая секция начнется через 13:50

Процессинг нескольких датасетов и батч-эффект

37:30

Следующая секция начнется через 13:50

Выделение HVG в каждом из батчей

41:59

Следующая секция начнется через 13:50

Шаги преобразования данных

44:13

Следующая секция начнется через 13:50

Совместное построение графа (BBKNN, conos)

58:58

Следующая секция начнется через 13:50

Батч-скорректированное представление (Scanorama, Harmony)

1:11:01

Следующая секция начнется через 13:50

Методы, устраняющие батч на уровне генов (Seurat CCA)

1:22:46

Следующая секция начнется через 13:50

Сравнение существующих методов

Свернуть таймкоды

00:00

00:00

Скорость

Качество

00:00

00:00

Скорость

Качество

Лекция 10. Коррекция батч-эффекта

Предыдущая лекция

Семинар 9. Методы снижения размерности

Следующая лекция

Семинар 10. Коррекция батч-эффекта