В.М. Мануйлов закончил аспирантуру мех-мата МГУ в 1986 г. Защитил под руководством проф. А. C. Мищенко в 1987 г. кандидатскую, а в 2000 г. - докторскую диссертацию. На кафедре высшей геометрии и топологии МГУ работает с 1995 г.

Область научных интересов: некоммутативная геометрия, в частности, теория гильбертовых модулей и K- (KK-, E-) теория C*-алгебр.