Курс «Методы молекулярной биологии» читается студентам пятого курса химического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова в весеннем семестре.В лекциях приводится описание достоинств и недостатков модельных организмов, рассказывается об основах световой и электронной микроскопии, методах разделения компонентов клетки (белков, нуклеиновых кислот и их комплексов), методах генетической инженерии, включая редактирование геномов, а также физических и физико-химических методах изучения структуры биомолекул и их взаимодействий друг с другом.Лекции предназначены для студентов химических, биологических и медицинских факультетов, а также могут быть полезны аспирантам, преподавателям и всем интересующимся тем, каким инструментарием располагает современная молекулярная биология.

Список всех тем лекций

Лекция 1. Введение.
Место молекулярной биологии в спектре наук Модельные организмы Размеры геномов Грам+ бактерии Грам+ бактерии в биотехнологии Модельные грам+ бактерии Грам- бактерии Микоплазмы Цианеи Great oxygenation Gram negative pathogens Commensal bacteria Хемотаксис Model gram negative bacteria Observable phenotypes of E.coli

Лекция 2. Эукариоты.
Повторение Instruments for genes replacement Археи Unique habitats Эукариоты Simbiosis theory Циклические хромосомы прокариот Движение Ядро Самые большие клетки эукариот Разнообразие одноклеточных эукариот Модельные эукариотические организмы Yeast Genetic manipulations Available strain collections Нематода Genome Модельный организм для изучения развития Доступные методы Морфология Дрозофила Модель для генетических исследований

Лекция 3. Микроскопия.Часть 1.
Повторение Млекопитающие как модельный объект Человек Микроскопия Световая микроскопия Типы световой микроскопии Phase contrast microscopy Конфокальная микроскопия Флюорофоры Immunistaining Fluorescent protein fusion Флуоресцентные белки RNA imaging in vivo

Лекция 4. Микроскопия. Часть 2.
Повторение DNA imaging in fixed cells Total internal reflection fluorescence microscopy TIRF application for single molecule interaction of biomolecules FACS Электронная микроскопия Cryoelectron microscopy Data acquisition Purification of cells components Desintegration of samples Lysis of yeast

Лекция 5. Выделение компонентов из клеток.
Выделение компонентов из клеток Table top centrifuge Medium speed preparative centrifuge Ultracentrifuge Chromatography Hydrophobic Affinity Affinity chromatography media Ultrafiltration Electrophoresis in agarose gels Capillary electrophoresis Southern blotting Protein gel elecrophoresis

Лекция 6. Генная инженерия.
Повторение Western blotting Methods for protein band visualisation Isoelectric focusing 2D gel electrophoresis Protein identification Генная инженерия Эндонуклеазы рестрикции Ревертаза РНК полимераза PNK Химический синтез ДНК Амплификация ДНК

Лекция 7. Секвенирование.
Секвенирование Секвенирование по Сэнгеру NGS Пиросеквенирование Illumina Применение NGS Translated regions Chromosome conformation capture DamID Vectors Plasmid features Phage vectors Methods for bacterial transformation Methods for eukaryotes transformation

Лекция 8. Работа с геномом.
Genome manipultion in bacteria Genome manipulation in yeast Methods for expression in eukaryotes Stable cell line construction Transposase assisted knock-in Создание мышей с измененным геномом Инактивация гена CRISPR Почему CRISPR лучше? Как это происходит? Как делать трансгенных мышей? А если мутация летальна? Как индуцировать Cre рекомбиназу? Векторы для работы со стволовыми клетками Инъекции в зиготу

Лекция 9. Методы спектроскопии ЯМР.
Методы спектроскопии ЯМР ЯМР-спектрометр Природа явления Ядра, которые видны в ЯМР 1D ЯМР-спектр Определение формулы вещества Сложные случаи COSY NOESY HSQC TOCSY DOSY Изучение макромолекул ЯМР биомакромолекул 3D спектр белка Изотопный состав Получение изотопнообогащенных белков Требования к объекту для структурных исследований методом ЯМР Взаимодействия с малыми молекулами ЯМР-скрининг Отслеживание изменений, происходящих с белком, во времени Изучение динамики биомакромолекул ЯМР-метаболомика

Лекция 10. Взаимодействие макромолекул.
Рентгеноструктурный анализ Molecular replacement R-factor PDB Аффинная хроматография TAP Other tags Affinity purification of RNA Yeast two-hybrid system Deletion analysis Cross-linking RNA(DNA)-protein interaction sites Surface plasmon resonance Isothermal titration calorimetry