Машинное обучение в иммунологии и медицине
Биоинженерия и биоинформатика
12 лекций
В рамках курса будут рассмотрены основы иммунологии, проведен обзор наиболее широко используемых в медицинской сфере методов машинного обучения, а также показаны особенности применения этих методов к иммунологическим и медицинским данным.
Навыки и знания после прохождения курса: Знание устройства и функционирования иммунной системы человека, навыки работы с иммунологическими данными, навыки применения методов машинного обучения в медицинских задачах, навыки анализа выживаемости.
Страница курса: https://intellect-foundation.r...
Материалы к курсу: https://drive.google.com/drive...
2022
лекции
спецкурс
ФББ
Биоинженерия и биоинформатика
спецкурс
Преподаватель
- 01:01:43Лекция 1. Введение в иммунологию. Поток информации в иммунной системе. Три типа иммунного ответа. Врожденный и приобретенный иммунитет
- 01:02:35Лекция 2. Типы клеток и молекул, участвующих в иммунных реакциях. Лимфоидные органы, комплемент, Т клетки, В клетки, клетки врожденного иммунитета
- 01:02:35Лекция 3. Адаптивный иммунитет. Т-клеточный ответ. В-клеточный ответ. Структура адаптивных иммунных рецепторов (TCR, BCR)
- 01:18:25Лекция 4. Данные в иммунологии и медицине. Работа с признаками. Feature engineering для медицинских данных
- 01:13:00Лекция 5. Получение данных в молекулярной биологии и их структура. Система iScan для поиска SNP. Чипы для измерения уровней экспресии генов. Хаускипинг гены. Нормировка
- 01:26:35Лекция 6. Получение данных в молекулярной биологии и их структура. Методы и задачи секвенирования. Скрининг мутаций по данным WES
- 01:47:15Лекция 7. Генерация разнообразия TCR, BCR. Созревание Т и В-клеток. Распознавание антигенов TCR, BCR
- 01:16:45Лекция 8. Особенности секвенирования TCR, BCR. Анализ Т- и В-клеточных репертуаров
- 49:52Лекция 9. Антигенпрезентация. Связывание пептидов с MHC
- 43:02Лекция 10. Введение в анализ выживаемости
- 55:28Лекция 11. Машинное обучение в анализе выживаемости
- 57:48Лекция 12. Нейронные сети в анализе выживаемости

