Войти
Химия 5 лекций
Внеклеточные нуклеиновые кислоты
Лектор
Зверева Мария Эмильевна
#лекции #спецкурс
Химический факультет
2022

Список всех тем лекций

Лекция 1. Внеклеточные нуклеиновые кислоты и их источники.
Химическая структура нуклеиновых кислот (НК) Три состояния внеклеточных НК Классификация внеклеточных НК Нетоз Взаимосвязь появления эндогенных и экзогенных внеклеточных НК Расщепление НК нуклеазами Апоптоз Некроз Менее характерные процессы появления внеклеточных НК Внеклеточная ДНК в жидкостях организма Внеклеточная ДНК в кровотоке при опухолевом процессе Показатели и маркеры для малоинвазивной диагностики Внеклеточная РНК в жидкостях организма

Лекция 2. Открытие и функции внеклеточных НК.
История открытия внеклеточных НК Биологические функции и структура внеклеточных НК Биологические функции эндогенных внеклеточных НК Мембранные частицы (внеклеточные везикулы) Липиды биологических мембран Общие экзосомальные поверхностные маркеры Базы данных состава везикул и экзосом РНК в содержимом экзосом/микровезикул Пути взаимодействия внеклеточных везикул с клеткой Т-клеточные экзосомы Экзосомы/микровезикулы стволовых клеток Различные пути биогенеза экзосом Участие внеклеточных везикул в естественных и патологических процессах

Лекция 3. Анализ внеклеточных НК.
Анализ внеклеточных НК в различных жидкостях организма Анализ малых количеств cfDNA Выделение и очистка НК  Вызовы для развития технологий определения ctDNA Методы обнаружения: секвенирование NGS TAm-Seq - направленное глубокое секвенирование Баркодирование Устранение мутаций с помощью цифровой технологии NGS Подготовка молекулярной библиотеки Биоинформатический анализ данных разными методами Мутационный анализ cfDNA, цкПЦР Повышение точности анализа: методы BEAMing и ARMS

Лекция 4. Внеклеточные ДНК.
Методы определения ctDNA: BEAMing Модификации ПЦР: ARMS, COLD-PCR ПЦР с использованием PNA и LNA Предел обнаружения мутантной аллельной фракции Уровень фрагментации внеклеточной ДНК Индекс целостности ДНК Влияние длины ампликона на эффективность определения Подходы к обнаружению соматических вариантов в cfDNA Транслокации в опухолевом геноме Глубина секвенирования и покрытие ДНК Клиническое применение различных анализов ctDNA Пренатальная диагностика на основе анализа cfDNA

Лекция 5. Внеклеточные РНК.
Циркулирующие опухолевые маркеры, экзосомы и CTCS Появление эндогенных внеклеточных РНК Биогенез и механизм действия микроРНК Взаимосвязь активации онкогенов и миРНК Биогенез и функции длинных некодирующих РНК Исследования неинвазивной диагностики на основе мРНК Корреляция опухолевой нагрузки и уровня ctRNA в плазме крови Анализ внеклеточной НК в случае идиопатической цитопении Диагностические маркеры при ишемической болезни сердца Экзосомальная кольцевая РНК в неинвазивной диагностике Комплексный анализ различных внеклеточных НК Технологические ограничения при анализе внеклеточных НК Поиск неинвазивного маркера