Список всех тем лекций
Лекция 1. Внеклеточные нуклеиновые кислоты и их источники.
Химическая структура нуклеиновых кислот (НК)
Три состояния внеклеточных НК
Классификация внеклеточных НК
Нетоз
Взаимосвязь появления эндогенных и экзогенных внеклеточных НК
Расщепление НК нуклеазами
Апоптоз
Некроз
Менее характерные процессы появления внеклеточных НК
Внеклеточная ДНК в жидкостях организма
Внеклеточная ДНК в кровотоке при опухолевом процессе
Показатели и маркеры для малоинвазивной диагностики
Внеклеточная РНК в жидкостях организма
Лекция 2. Открытие и функции внеклеточных НК.
История открытия внеклеточных НК
Биологические функции и структура внеклеточных НК
Биологические функции эндогенных внеклеточных НК
Мембранные частицы (внеклеточные везикулы)
Липиды биологических мембран
Общие экзосомальные поверхностные маркеры
Базы данных состава везикул и экзосом
РНК в содержимом экзосом/микровезикул
Пути взаимодействия внеклеточных везикул с клеткой
Т-клеточные экзосомы
Экзосомы/микровезикулы стволовых клеток
Различные пути биогенеза экзосом
Участие внеклеточных везикул в естественных и патологических процессах
Лекция 3. Анализ внеклеточных НК.
Анализ внеклеточных НК в различных жидкостях организма
Анализ малых количеств cfDNA
Выделение и очистка НК
Вызовы для развития технологий определения ctDNA
Методы обнаружения: секвенирование NGS
TAm-Seq - направленное глубокое секвенирование
Баркодирование
Устранение мутаций с помощью цифровой технологии NGS
Подготовка молекулярной библиотеки
Биоинформатический анализ данных разными методами
Мутационный анализ cfDNA, цкПЦР
Повышение точности анализа: методы BEAMing и ARMS
Лекция 4. Внеклеточные ДНК.
Методы определения ctDNA: BEAMing
Модификации ПЦР: ARMS, COLD-PCR
ПЦР с использованием PNA и LNA
Предел обнаружения мутантной аллельной фракции
Уровень фрагментации внеклеточной ДНК
Индекс целостности ДНК
Влияние длины ампликона на эффективность определения
Подходы к обнаружению соматических вариантов в cfDNA
Транслокации в опухолевом геноме
Глубина секвенирования и покрытие ДНК
Клиническое применение различных анализов ctDNA
Пренатальная диагностика на основе анализа cfDNA
Лекция 5. Внеклеточные РНК.
Циркулирующие опухолевые маркеры, экзосомы и CTCS
Появление эндогенных внеклеточных РНК
Биогенез и механизм действия микроРНК
Взаимосвязь активации онкогенов и миРНК
Биогенез и функции длинных некодирующих РНК
Исследования неинвазивной диагностики на основе мРНК
Корреляция опухолевой нагрузки и уровня ctRNA в плазме крови
Анализ внеклеточной НК в случае идиопатической цитопении
Диагностические маркеры при ишемической болезни сердца
Экзосомальная кольцевая РНК в неинвазивной диагностике
Комплексный анализ различных внеклеточных НК
Технологические ограничения при анализе внеклеточных НК
Поиск неинвазивного маркера
