Машинное обучение в структурной биологии
Структурная биология - активно развивающаяся область, использующаяся в других разделах биологии, в медицине и в фармакологии. В последнее время в нее активно проникают подходы, основанные на машинном обучении. Оно используется для обработки экспериментальных данных (ЯМР, РСА, криогенная микроскопия), генерации новых веществ, анализа результатов докинга, предсказания белок-белковых взаимодействий, предсказания свойств и токсичности для человека химических веществ. Также машинное обучение используется для ускорения традиционных подходов структурной биологии, таких как молекулярная динамика и квантово-механическое моделирование.
Основной задачей курса «Машинное обучение в структурной биологии» является ознакомление слушателей как с классическими подходами структурной биологии, так и с их аналогами, построенными на основе машинного обучения.
Продолжительность курса: 1 семестр (6 теоретических и 6 практических занятий).
Курс ориентирован на магистров и аспирантов биологических и химических специализаций. В ходе данного курса слушатели ознакомятся с теоретическими основами классических и ML-подходов в структурной биологии, а затем на практике их применят, смогут сравнить полученные результаты.
В результате прохождения курса слушатели смогут самостоятельно ставить задачи на языке структурной биологии и решать их новейшими методами.
- 01:19:19Лекция 1. Введение в структуру белка. Молекулярная механика и квантовая химия
- 01:54:43Лекция 2. Хемоинформатика
- 01:48:17Лекция 3. Межмолекулярные взаимодействия белок-лиганд
- 01:28:59Лекция 4. Сравнительное моделирование
- 01:15:58Лекция 5. Белок-белковые взаимодействия
- 01:21:22Лекция 6. Машинные модели для расчёта свойств электронной структуры молекул

